都道府县
日本各都道府县徽标
日本的都、道、府、县是平行的一级行政区，直属中央政府，都拥有自治权。全国分为东京都、北海道、大阪府、京都府和43个县，日本中央政府部门叫“省”，比如“厚生劳动省”等。其办事机构称为“厅”，即“都厅”、“道厅”、“府厅”、“县厅”，行政长官称为“知事”。一级行政区下设若干个市、町、村。其办事机构称“役所”，即“市役所”、“町役所”、“村役所”，行政长官称为“市长”、“町长”、“村长”。
截至2016年10月，日本有791个市、744个町、183个村，共计有1718个市町村。加上东京都23个行政区，达到1741个市町村。此外，还有47个县级单位，也就是1都（东京都）、1道（北海道）、2府（大阪府和京都府），以及43个县（日语：県）。政令城市共有20个，共有47个中核市，37个特别市。
日本地域
日本地区图
日本地域中将全国划分为八大地方：
日本行政区划图
北海道地方：北海道（ほっかいどう）
东北地方（とうほくちほう）：青森（あおもり）岩手（いわて）宫城（みやぎ）秋田（あきた）山形（やまがた）福岛（ふくしま）
关东地方（かんとうちほう）：茨城（いばらき）栃木（とちぎ）群马（ぐんま）埼玉（さいたま）千叶（ちば）神奈川（かながわ）东京都（とうきょうと）
中部地方（ちゅうぶちほう）：新潟（にいがた）富山（とやま）石川（いしかわ）福井（ふくい）山梨（やまなし）长野（ながの）岐阜（ぎふ）静冈（しずおか）爱知（あいち）
近畿地方（きんきちほう）：三重（みえ）滋贺（しが）京都府（きょうとふ）大阪府（おおさかふ）兵库（ひょうご）奈良（なら）和歌山（わかやま）
中国地方，四国地方（ちゅうごくしこくちほう）：鸟取（とっとり）岛根（しまね）冈山（おかやま）广岛（ひろしま）山口（やまぐち）徳岛（とくしま）香川（かがわ）爱媛（えひめ）高知（こうち）
九州地方（きゅうしゅうちほう）：福冈（ふくおか）佐贺（さが）长崎（ながさき）熊本（くまもと）大分（おおいた）宫崎（みやざき）鹿儿岛（かごしま）冲绳（おきなわ）
主要城市
日本拥有以日本三大都市圈为核心组成的日本太平洋沿岸城市群。2012年1月23日，日本政府正式决定成立复兴厅，以应对东日本大地震。复兴厅的设置期限为震后10年。总部设于东京，并在盛冈、仙台和福岛3市设置统筹支部的“复兴局”。